Căn cứ pháp lý

Theo điểm d khoản 3 Điều 13 Nghị định 123/2020/NĐ-CP, quy định áp dụng hóa đơn điện tử khi bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ như sau:

Tổ chức kinh doanh kê khai, nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ khi điều chuyển hàng hóa cho các cơ sở hạch toán phụ thuộc như chi nhánh, cửa hàng ở địa phương khác (tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương) hoặc giữa các chi nhánh với nhau, có thể lựa chọn một trong hai cách sử dụng hóa đơn, chứng từ:

• Sử dụng hóa đơn điện tử giá trị gia tăng để làm căn cứ thanh toán và kê khai thuế GTGT ở từng đơn vị, từng khâu độc lập với nhau.

• Sử dụng Phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ hoặc phiếu xuất kho hàng gửi bán đại lý đối với hàng hóa xuất cho cơ sở làm đại lý.

Chi nhánh, cửa hàng, cơ sở nhận làm đại lý bán hàng khi bán hàng phải lập hóa đơn giao cho người mua, đồng thời lập Bảng kê hàng hóa bán ra gửi về cơ sở có hàng để cơ sở đó lập hóa đơn GTGT cho hàng hóa thực tế tiêu thụ.

Trường hợp có số lượng và doanh số lớn, bảng kê có thể lập 5 hoặc 10 ngày một lần. Nếu hàng hóa bán ra có thuế suất GTGT khác nhau, phải lập bảng kê riêng theo từng nhóm thuế suất.

Các cơ sở phụ thuộc thực hiện kê khai nộp thuế GTGT với số hàng xuất bán và được khấu trừ thuế GTGT đầu vào theo hóa đơn từ cơ sở giao hàng.

Trường hợp đặc biệt: Đối với đơn vị phụ thuộc của cơ sở kinh doanh nông, lâm, thủy sản kê khai thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, khi thu mua hàng và điều chuyển về trụ sở chính, thì sử dụng Phiếu xuất kho kiêm vận chuyển nội bộ, không sử dụng hóa đơn điện tử GTGT.

Kết luận theo quy định

✅ Chi nhánh hạch toán phụ thuộc (trừ một số trường hợp đặc thù) có quyền xuất hóa đơn GTGT để làm căn cứ thanh toán và kê khai thuế ở từng đơn vị, từng khâu độc lập.

🚫 Nếu tổng công ty xuất hóa đơn thay cho chi nhánh cung cấp dịch vụ (không phải được ủy nhiệm), thì về nguyên tắc người cung cấp dịch vụ là tổng công ty, chứ không còn là chi nhánh – điều này không đúng thực tế giao dịch.

✅ Đối với chi nhánh hạch toán độc lập, vẫn là chi nhánh trực tiếp xuất hóa đơn, không phải tổng công ty.

📌 Tuy nhiên, tổng công ty có thể ủy quyền cho chi nhánh xuất hóa đơn, và trong trường hợp này tên nhà cung cấp dịch vụ là tổng công ty (được ghi rõ trong ủy quyền và hóa đơn).