Thuế giá trị gia tăng đầu vào của hàng tồn kho bị tổn thất có được khấu trừ không?

Vấn đề khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào đối với hàng tồn kho bị tổn thất, hư hỏng không được bồi thường là nội dung được nhiều doanh nghiệp quan tâm trong bối cảnh các quy định về quản lý thuế và kế toán có những cập nhật mới. Dưới đây là phân tích chi tiết dựa trên các văn bản pháp luật hiện hành.

Thuế giá trị gia tăng đầu vào của hàng tồn kho bị tổn thất do hư hỏng không được bồi thường có được khấu trừ không?

Căn cứ khoản 1 Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, quy định về khấu trừ thuế giá trị gia tăng như sau:

Thuế giá trị gia tăng đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế giá trị gia tăng được khấu trừ toàn bộ, kể cả thuế giá trị gia tăng đầu vào không được bồi thường của hàng hóa, dịch vụ chịu thuế giá trị gia tăng bị tổn thất, hàng hóa bị hao hụt tự nhiên do tính chất lý hóa trong quá trình vận chuyển. Cơ sở kinh doanh phải có đầy đủ hồ sơ, tài liệu chứng minh các trường hợp tổn thất không được bồi thường để khấu trừ thuế. Trường hợp pháp luật có quy định về định mức hao hụt tự nhiên thì cơ sở kinh doanh được khấu trừ số thuế giá trị gia tăng đầu vào của số lượng hàng hóa thực tế hao hụt tự nhiên không vượt quá định mức hao hụt theo quy định, số thuế giá trị gia tăng đầu vào của số lượng hàng hóa vượt định mức hao hụt không được khấu trừ thuế.

Theo hướng dẫn tại Công văn 10744/BNI-QLDN1 năm 2025, đối với hàng hóa chịu thuế giá trị gia tăng bị tổn thất không được bồi thường, doanh nghiệp vẫn được khấu trừ thuế nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định tại Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP. Lưu ý rằng, đối với các trường hợp có định mức hao hụt tự nhiên, phần thuế của hàng hóa vượt định mức sẽ không được khấu trừ.

Tổng hợp 7 biểu mẫu chứng từ kế toán hàng tồn kho theo Thông tư 99 áp dụng từ 01/01/2026

Theo quy định tại Mục 2 Phần B Phụ lục I ban hành kèm Thông tư 99/2025/TT-BTC, các đơn vị kế toán cần tuân thủ sử dụng các biểu mẫu chứng từ sau:

Các chứng từ này là căn cứ pháp lý quan trọng để theo dõi tình hình nhập, xuất, tồn kho và phục vụ công tác quản trị doanh nghiệp. TẢI VỀ: File word tổng hợp 7 biểu mẫu chứng từ kế toán hàng tồn kho theo Thông tư 99

Khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào đối với cơ sở kinh doanh nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ thuế được quy định như thế nào?

Tại khoản 1 Điều 14 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, các nguyên tắc khấu trừ được xác định rõ:

• Thuế giá trị gia tăng đầu vào của hàng hóa, dịch vụ phục vụ sản xuất, kinh doanh chịu thuế được khấu trừ toàn bộ, bao gồm cả trường hợp tổn thất không được bồi thường.
• Trường hợp sử dụng đồng thời cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa chịu thuế và không chịu thuế, doanh nghiệp chỉ được khấu trừ thuế đầu vào tương ứng với phần sản xuất, kinh doanh hàng hóa chịu thuế.
• Đối với thuế đầu vào không được khấu trừ, doanh nghiệp được tính vào chi phí được trừ khi xác định thuế thu nhập doanh nghiệp hoặc tính vào nguyên giá tài sản cố định.